ProjectZero ist im „Project Zero Fonden“ verankert, der mit Einlagen von u. a. der Kommune Sønderborg, Danfoss (Bitten & Mads Clausens Fond) und SYD ENERGI gegründet wurde.
Der Vorstand des Fonds besteht aus (Stand Oktober 2007):
Peter M. Clausen (Vorsitzender), Vorsitzender des Bitten & Mads Clausens Fond
Ebbe Seligmann, Geschäftsführer, SYD ENERGI
Jan Prokopek, Bürgermeister, Kommune Sonderburg
Aase Nyegaard, stellvertretende Bürgermeisterin, Kommune Sonderburg
Bjarne G. Sørensen, Prorektor, Süddänische Universität (SDU)
Per Have, Geschäftsführer, Bitten & Mads Clausens Fond
Ole Damm, Geschäftsführer, Enervision A/S
Asger Gramkow, Vorsitzender, Denkfabrik Futura Syd
Der Vorstand des Fonds ist verantwortlich für die Anstellung der Geschäftsführung des Projekts.